植wuye绿体基因zu反向重复序列的大数据分析及数据库构jian取得新jin展
发布时间: 2019-10-08 | 浏览ci数: 137 | 文zhangzuo者: | 发布人: 植保学院

大嘴棋牌zai植wuye绿体基因zu反向重复序列的大数据分析及数据库构jianshang取得了新jin展,相guan研究成果yiPCIRa database of Plant Chloroplast Inverted Repeats为ti,发表zaiSCI蕑hang嫉摹迭/span>Database》shang(五年影响因子3.793)。

反向重复序列(IRs)是植wuzhong常见的高jiDNA二ji结构,canyu基因沉默、DNA复制和基因zu稳ding等重要生wu过程,随着植wu测序wu种的增多,植wuye绿体zhongjinxing反向重复序列的大规模扫描和分析也逐渐提shang日程。ben研究从gong共数据平台shang获得了113个植wuye绿体的基因zu及注释文件,li用perl程序duiIRs结构jinxing了分析和预测。共得到21,433个预测的IRs,jin而构jian了一个有guan植wuye绿体IRs的综he数据平台(http://biodb.sdau.edu.cn/pcir/index.php)。该平台提供了植wuIRsxin息,keyishixianzai线查找、展shi、分析。该平台还提供了geneCDSFASTA文件zhong的IRsxin息zai线预测及分析的工具。

ben论文的第一zuo者为大嘴棋牌17jiyan草zhuanye硕士研緆e舝ui,植保学院的杨龙副教授为通迅zuo者,该项mu受到shan东shengxiandai农yechanye体系资助。